RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTMR1Q13613 665 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNPTABQ3T906 1256 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLIC4Q9Y696 253 aa21.18■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEMFO60524 1076 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARIH2O95376 493 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYBAP13498 195 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ICAM3P32942 547 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 GJA10Q969M2 543 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.17■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 MSH4O15457 936 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 FIBPO43427 364 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP9AO75110 1047 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 INHAP05111 366 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO1Q5XXA6 986 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.16■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTGS1P23219 599 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 SP2Q02086 613 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTGDRQ13258 359 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 LY6KQ17RY6 165 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCFD2Q8WU76 684 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.15■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAFGO15525 162 aa21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADCY6O43306 1168 aa21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CENPFP49454 3210 aa21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 HAS1Q92839 578 aa21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDHR1Q96JP9 859 aa21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
USP3-AS1-203ENST00000559737 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNA2P16389 499 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTLL4Q14679 1199 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPAQ15257 358 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 CALCRLQ16602 461 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 COPS5Q92905 334 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTMR9Q96QG7 549 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.13■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SORBS3O60504 671 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TGFB3P10600 412 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMPD1P17405 629 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNGA1P29973 690 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATL3Q6DD88 541 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC5A5Q92911 643 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBX3O15119 743 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR52Z1P0C646 297 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNFAIP2Q03169 654 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 CFAP45Q9UL16 551 aa21.12■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 MARCH6O60337 910 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 GGPS1O95749 300 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKR1A1P14550 325 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 TXKP42681 527 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT85P78386 507 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC39A14Q15043 492 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM20AQ96MK3 541 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.11■□□□□ 0.97
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms