RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	PLCD1	P51178	756 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	EHD4	Q9H223	541 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	CFH	P08603	1231 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	PPP4C	P60510	307 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	FOXC1	Q12948	553 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	HIC1	Q14526	733 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCD4-222	ENST00000555617	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	COPS5	Q92905	334 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	P2RX5	Q93086	422 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TTC3	P53804	2025 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNK5	O95279	499 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	MMP3	P08254	477 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CPT1A	P50416	773 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TDG	Q13569	410 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	NELL1	Q92832	810 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GIPC1	O14908	333 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TIMM10	P62072	90 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GABPA	Q06546	454 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	KAT2B	Q92831	832 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ERVFC1	P60507	584 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617		A6NJR5	290 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	LAMA1	P25391	3075 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ASB14	A6NK59	587 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	BAG3	O95817	575 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	PLCG2	P16885	1265 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-222	ENST00000555617	CAPNS1	P04632	268 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ICA1	Q05084	483 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PTK7	Q13308	1070 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CSRP2	Q16527	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-222	ENST00000555617	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21

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