RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 CDH22Q9UJ99 828 aa8.01□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.01□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A0D9SFI3 127 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TSPY2A6NKD2 308 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 H3BNC9 293 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TREHO43280 583 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 MBTPS2O43462 519 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 CTSHP09668 335 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SNHG28P0DPA3 235 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 FDX1P10109 184 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF543Q08ER8 600 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 MFSD10Q14728 455 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM192Q8IY95 271 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 DCAF4Q8WV16 495 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 C16orf70Q9BSU1 422 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 NAPBQ9H115 298 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 DCTPP1Q9H773 170 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 NOD1Q9Y239 953 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SALL3Q9BXA9 1300 aa8□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 F2P00734 622 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 GH1P01241 217 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 FGAP02671 866 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 GATMP50440 423 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 PTK7Q13308 1070 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 IKBKEQ14164 716 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM50Q86XT4 487 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 MIER1Q8N108 512 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 CAGE1Q8TC20 777 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 IGFLR1Q9H665 355 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 CLEC1BQ9P126 229 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 HCSTQ9UBK5 93 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 NEDD4P46934 1319 aa7.99□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ORC4O43929 436 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 HMMRO75330 724 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 GLP2RO95838 553 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ALADP13716 330 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 GNAT2P19087 354 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXC8P31273 242 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 THPOP40225 353 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SEMA3FQ13275 785 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SERINC5Q86VE9 423 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 FBXO11Q86XK2 927 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 C7orf31Q8N865 590 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TOP1MTQ969P6 601 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SETD4Q9NVD3 440 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 INSL6Q9Y581 213 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 KPNA6O60684 536 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 CHRNA1P02708 482 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RSPH10BP0C881 870 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 DNERQ8NFT8 737 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 RMDN3Q96TC7 470 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 FSD1Q9BTV5 496 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 SENP2Q9HC62 589 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.97□□□□□ -1.13
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM221A6NGB7 291 aa7.96□□□□□ -1.14
CTDSP2-208ENST00000552294 M0R296 226 aa7.96□□□□□ -1.14
CTDSP2-208ENST00000552294 GGPS1O95749 300 aa7.96□□□□□ -1.14
CTDSP2-208ENST00000552294 NR3C2P08235 984 aa7.96□□□□□ -1.14
CTDSP2-208ENST00000552294 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.96□□□□□ -1.14
CTDSP2-208ENST00000552294 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms