RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.39■■□□□ 1.01
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CTDSP2-207ENST00000551594 PRR16Q569H4 304 aa21.36■■□□□ 1.01
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CTDSP2-207ENST00000551594 LAMC2Q13753 1193 aa21.32■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 NEDD9Q14511 834 aa21.32■■□□□ 1
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CTDSP2-207ENST00000551594 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.32■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 KBTBD13C9JR72 458 aa21.31■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 DNM1LO00429 736 aa21.31■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 MSH4O15457 936 aa21.31■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CTDSP2-207ENST00000551594 SP4Q02446 784 aa21.31■■□□□ 1
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