RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 PDIA5Q14554 519 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 E2F4Q16254 413 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC15Q8TF66 581 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 DHX58Q96C10 678 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 MROH8Q9H579 483 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 TSKSQ9UJT2 592 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 ASTN1O14525 1302 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 FKTNO75072 461 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPK4P31152 587 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.77■■□□□ 1.56
PACSIN3-209ENST00000532457 LCTP09848 1927 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 TBX3O15119 743 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCH6O60337 910 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF6Q15052 776 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 AK8Q96MA6 479 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PORCNQ9H237 461 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO40Q9UH90 709 aa24.76■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 CNNM3Q8NE01 707 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PLIN2Q99541 437 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 MAF1Q9H063 256 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 NR3C2P08235 984 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 UBA7P41226 1012 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ERO1AQ96HE7 468 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM20AQ96MK3 541 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A087WWV3 80 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAGE5O15320 804 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR78Q5VTH9 848 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 CABP7Q86V35 215 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 EFCC1Q9HA90 598 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 SLFN14P0C7P3 912 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 FCGRTP55899 365 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PNOCQ13519 176 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 VAV3Q9UKW4 847 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 FSD2A1L4K1 749 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 STRNO43815 780 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PRR29P0C7W0 189 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ECM1Q16610 540 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC5A5Q92911 643 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 MTRQ99707 1265 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 JADE2Q9NQC1 790 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMC4P43686 418 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PNMA5Q96PV4 448 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 DISC1Q9NRI5 854 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PFASO15067 1338 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMD10O75832 226 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 RGS20O76081 388 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PGK2P07205 417 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 GRB10Q13322 594 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 IQUBQ8NA54 791 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 STAMQ92783 540 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 PAGE5Q96GU1 130 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 GNRH1P01148 92 aa24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR142Q7Z601 462 aa24.7■■□□□ 1.55
PACSIN3-209ENST00000532457 EML1O00423 815 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 FCER1AP12319 257 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 PLCG1P19174 1290 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 CASP1P29466 404 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 CCND2P30279 289 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 TXLNAP40222 546 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 FGD4Q96M96 766 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-209ENST00000532457 RBSNQ9H1K0 784 aa24.7■■□□□ 1.54
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