RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP4R3AQ6IN85 833 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MTMR8Q96EF0 704 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TLR10Q9BXR5 811 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RASSF4Q9H2L5 321 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SBF2Q86WG5 1849 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 RUBCNQ92622 972 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 EHD2Q9NZN4 543 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 RSPH14Q9UHP6 348 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC1A4P43007 532 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 NOX5Q96PH1 765 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 NLRC4Q9NPP4 1024 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAF5O00463 557 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 ZCWPW2Q504Y3 356 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 HAS1Q92839 578 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GJA10Q969M2 543 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 BUB1O43683 1085 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SNHG28P0DPA3 235 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PAFAH1B1P43034 410 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2SQ16763 222 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SLF2Q8IX21 1173 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 COASYQ13057 564 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 STIM2Q9P246 746 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA6CA6NDK9 693 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA6DP0CG33 693 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM76AQ8TAV0 307 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 C8orf37Q96NL8 207 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GGA1Q9UJY5 639 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 NOL4O94818 638 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PANK4Q9NVE7 773 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 GAKO14976 1311 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 AKR1B1P15121 316 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP2B4P23634 1241 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC40Q4G0X9 1142 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP72Q9P209 647 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 TLR2O60603 784 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PPFIA4O75335 1185 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SEPT2Q15019 361 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 MARCH6O60337 910 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PICALMQ13492 652 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM26FQ5R3K3 315 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SFMBT2Q5VUG0 894 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 GABPAQ06546 454 aa29.89■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 MS4A14Q96JA4 679 aa29.89■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPING1P05155 500 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 EPHB4P54760 987 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TMC4Q7Z404 712 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 NGLY1Q96IV0 654 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF543Q08ER8 600 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CFAP221Q4G0U5 840 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 C8orf74Q6P047 294 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 EMBQ6PCB8 327 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R18Q6NYC8 613 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CUL5Q93034 780 aa29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms