RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 PPP2R2DQ66LE6 453 aa28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SLC9A7Q96T83 725 aa28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 HAS3O00219 553 aa28.49■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 GNPTABQ3T906 1256 aa28.49■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 USP38Q8NB14 1042 aa28.49■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa28.49■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 PPFIA4O75335 1185 aa28.48■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 SMARCA1P28370 1054 aa28.48■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 RBL2Q08999 1139 aa28.48■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.48■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.48■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 STAM2O75886 525 aa28.47■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SELPP16109 830 aa28.47■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.47■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.47■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 BAIAP3O94812 1187 aa28.46■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.46■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.46■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 CUL9Q8IWT3 2517 aa28.46■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 TET1Q8NFU7 2136 aa28.45■■■□□ 2.15
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ALYREF-203ENST00000511412 CALM2P0DP24 149 aa28.45■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 CALM3P0DP25 149 aa28.45■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 CKBP12277 381 aa28.45■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 RXRAP19793 462 aa28.45■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 LIFRP42702 1097 aa28.45■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 NECTIN1Q15223 517 aa28.45■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.45■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 IGFBP4P22692 258 aa28.44■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.43■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.42■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.42■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 LGALS2P05162 132 aa28.41■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.41■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.41■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 METTL7BQ6UX53 244 aa28.41■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 SKAP1Q86WV1 359 aa28.41■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.41■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 NBNO60934 754 aa28.4■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 SEMA3FQ13275 785 aa28.4■■■□□ 2.14
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ALYREF-203ENST00000511412 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 H3BRB1 525 aa28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 WDR5P61964 334 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 MICU3Q86XE3 530 aa28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.39■■■□□ 2.14
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.38■■■□□ 2.13
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