RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 COPS5Q92905 334 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 DEFB118Q96PH6 123 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 SP2Q02086 613 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 PKP1Q13835 747 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 TNS4Q8IZW8 715 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 SORBS3O60504 671 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 RARBP10826 455 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 CYP3A7P24462 503 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 RESTQ13127 1097 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 LHX8Q68G74 356 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 LENG9Q96B70 501 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 ABHD8Q96I13 439 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 CDHR1Q96JP9 859 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 UIMC1Q96RL1 719 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 SLC37A4O43826 429 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 MSCO60682 206 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 ATP9AO75110 1047 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 TGFB3P10600 412 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 MBOAT7Q96N66 472 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD10-202ENST00000490088 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MAFGO15525 162 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GJB1P08034 283 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 NBR1Q14596 966 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 Q4G0T1 1027 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 BRAPQ7Z569 592 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 TLK2Q86UE8 772 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GGPS1O95749 300 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 PGK1P00558 417 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 KCNA2P16389 499 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 TTC38Q5R3I4 469 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MSH4O15457 936 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GH1P01241 217 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MCM7P33993 719 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 TRAPPC10P48553 1259 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ARHGAP1Q07960 439 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF174Q15697 407 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 POTEFA5A3E0 1075 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 SGPL1O95470 568 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 NEDD9Q14511 834 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 POTEDQ86YR6 584 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 Q9Y3F1 56 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MYADML2A6NDP7 307 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ADAMTS4O75173 837 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GJA8P48165 433 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GJA9P57773 515 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 GJA10Q969M2 543 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD10-202ENST00000490088 NEMFO60524 1076 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms