RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 APOA5Q6Q788 366 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.65■■□□□ 1.06
UPP1-211ENST00000482015 KRT32Q14532 448 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 MFSD10Q14728 455 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 SESTD1Q86VW0 696 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PBX4Q9BYU1 374 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.64■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PPFIA4O75335 1185 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 F2P00734 622 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CPA1P15085 419 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 GNPTABQ3T906 1256 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 C7orf31Q8N865 590 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 RETREG2Q8NC44 543 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 TIFAQ96CG3 184 aa21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HAS3O00219 553 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PITPNM1O00562 1244 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB43O43298 467 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 STAM2O75886 525 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 IQCF3P0C7M6 154 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 ICAM3P32942 547 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 SEMA3FQ13275 785 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 BFSP2Q13515 415 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 UBE2SQ16763 222 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 MYLIPQ8WY64 445 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.62■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 RTN1Q16799 776 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 KCNB2Q92953 911 aa21.61■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 ZBBXA8MT70 800 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 FIBPO43427 364 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HSPA4P34932 840 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 GRIN2CQ14957 1233 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 ZNF576Q9H609 170 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.6■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 NEFLP07196 543 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PFKMP08237 780 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 RFC2P35250 354 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 FGD1P98174 961 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 FUT2Q10981 343 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 NEDD9Q14511 834 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 HIC1Q14526 733 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CAGE1Q8TC20 777 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CDC27P30260 824 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 METTL7BQ6UX53 244 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 Q6ZUG5 572 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 NLRX1Q86UT6 975 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.58■■□□□ 1.05
UPP1-211ENST00000482015 CDH23Q9H251 3354 aa21.58■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 LGALS2P05162 132 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 RABGGTBP53611 331 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 SP4Q02446 784 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 APOBRQ0VD83 1088 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 GPR20Q99678 358 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 MSRAQ9UJ68 235 aa21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 H3BRB1 525 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 CKBP12277 381 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 FOSL2P15408 326 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 SELPP16109 830 aa21.56■■□□□ 1.04
UPP1-211ENST00000482015 ITGB5P18084 799 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms