RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CHMP4BP1P59074 171 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 SP2Q02086 613 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 MFSD10Q14728 455 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 NECTIN1Q15223 517 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 USP38Q8NB14 1042 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 SLC9A7Q96T83 725 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 MYL10Q9BUA6 226 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN4-204ENST00000426921 ICAM3P32942 547 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 LIFRP42702 1097 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 RABGGTBP53611 331 aa24.07■■□□□ 1.44
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UBXN4-204ENST00000426921 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 C7orf31Q8N865 590 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA33Q96N06 139 aa24.07■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PIK3CDO00329 1044 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 BAIAP3O94812 1187 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 SELPP16109 830 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 GNAQP50148 359 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 GPNMBQ14956 572 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 TET1Q8NFU7 2136 aa24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PTK7Q13308 1070 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 ADGRE1Q14246 886 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 GNPTABQ3T906 1256 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 ALG1Q9BT22 464 aa24.05■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC69A6NI79 296 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 MEIS2O14770 477 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CXCL10P02778 98 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CALM1P0DP23 149 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CALM2P0DP24 149 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CALM3P0DP25 149 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 MYOGP15173 224 aa24.04■■□□□ 1.44
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UBXN4-204ENST00000426921 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
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UBXN4-204ENST00000426921 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 CKBP12277 381 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 HOXC8P31273 242 aa24.03■■□□□ 1.44
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UBXN4-204ENST00000426921 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.02■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 FIBPO43427 364 aa24.02■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.02■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 METTL7BQ6UX53 244 aa24.02■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 MYO9BQ13459 2157 aa24.02■■□□□ 1.44
UBXN4-204ENST00000426921 SORBS3O60504 671 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 CA3P07451 260 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 NEDD9Q14511 834 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 HIC1Q14526 733 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 CUL5Q93034 780 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 WNT8BQ93098 351 aa24.01■■□□□ 1.43
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UBXN4-204ENST00000426921 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.01■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 TRANK1O15050 2925 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 NBNO60934 754 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 LGALS2P05162 132 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 RXRAP19793 462 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 SERINC5Q86VE9 423 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 SENP7Q9BQF6 1050 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 PTPRSQ13332 1948 aa24■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 H3BRB1 525 aa23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 RNF20Q5VTR2 975 aa23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 FANCBQ8NB91 859 aa23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 USP26Q9BXU7 913 aa23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 KCNJ6P48051 423 aa23.98■■□□□ 1.43
UBXN4-204ENST00000426921 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.98■■□□□ 1.43
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