RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377526.3

AUP1-201, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AUP1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-201ENST00000377526 TRPV1Q8NER1 839 aa22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 GPRASP2Q96D09 838 aa22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.14■■□□□ 1.14
AUP1-201ENST00000377526 MSH4O15457 936 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ARIH2O95376 493 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 HMGCRP04035 888 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ICAM3P32942 547 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 GNPTABQ3T906 1256 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 GJA10Q969M2 543 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.14■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 FIBPO43427 364 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 GRK4P32298 578 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 PTGDRQ13258 359 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 PTPAQ15257 358 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.13■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ATP9AO75110 1047 aa22.12■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CYBAP13498 195 aa22.12■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 HAS1Q92839 578 aa22.12■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.12■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SP2Q02086 613 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CALCRLQ16602 461 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 MTMR9Q96QG7 549 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ADCY6O43306 1168 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 INHAP05111 366 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 KCNA2P16389 499 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 PTGS1P23219 599 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ATL3Q6DD88 541 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SCFD2Q8WU76 684 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CDHR1Q96JP9 859 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.11■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 MAFGO15525 162 aa22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 KRT85P78386 507 aa22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 LY6KQ17RY6 165 aa22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SLC5A5Q92911 643 aa22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 OR52Z1P0C646 297 aa22.09■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CFAP45Q9UL16 551 aa22.09■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.09■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 TBX3O15119 743 aa22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 YEATS4O95619 227 aa22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 TTLL4Q14679 1199 aa22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SLC39A14Q15043 492 aa22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 COPS5Q92905 334 aa22.08■■□□□ 1.13
AUP1-201ENST00000377526 SORBS3O60504 671 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 BMP15O95972 392 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 TGFB3P10600 412 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 SMPD1P17405 629 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 STK38Q15208 465 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 IL17AQ16552 155 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 FAM20AQ96MK3 541 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 BRCA2P51587 3418 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 LAD1O00515 517 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 PSMD10O75832 226 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 TXKP42681 527 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-201ENST00000377526 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms