RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DESI2Q9BSY9 194 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RMND1Q9NWS8 449 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GUL6 1792 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 A6NHS1 94 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 A6NJY4 79 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 KRT86O43790 486 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZEB2O60315 1214 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FGFR2P21802 821 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PDE6BP35913 854 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MAP2K2P36507 400 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GRM5P41594 1212 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LIFRP42702 1097 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RBL2Q08999 1139 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GRAPQ13588 217 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TMTC2Q8N394 836 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FERMT2Q96AC1 680 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RUFY1Q96T51 708 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TINF2Q9BSI4 451 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.01□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO5BA8MYB1 307 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 BBOX1O75936 387 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FGAP02671 866 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 AMPD2Q01433 879 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNDQ07001 517 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DDR1Q08345 913 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM32Q13049 653 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ALS2CLQ60I27 953 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 RNF34Q969K3 372 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FAM129BQ96TA1 746 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CAPS2Q9BXY5 557 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 IL21Q9HBE4 155 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 KLK14Q9P0G3 267 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 GGA2Q9UJY4 613 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ECM29Q5VYK3 1845 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQC6 194 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DEXIO95424 95 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MMP1P03956 469 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MMP10P09238 476 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 IFNAR1P17181 557 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 BMP6P22004 513 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CALRP27797 417 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 INPP5BP32019 993 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FOXK2Q01167 660 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PDE4BQ07343 736 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 ORC1Q13415 861 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 DRP2Q13474 957 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 PLCB4Q15147 1175 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 APOA5Q6Q788 366 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC50Q8IVM0 306 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 NUP58Q9BVL2 599 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 MINPP1Q9UNW1 487 aa8□□□□□ -1.13
CTPS1-201ENST00000372616 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms