RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335760.9

APOBEC3B-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOBEC3B, Length 1,359 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-202ENST00000335760 SEMA3FQ13275 785 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MTMR1Q13613 665 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 TTLL4Q14679 1199 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 LY6KQ17RY6 165 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MOXD1Q6UVY6 613 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 CDHR1Q96JP9 859 aa16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 WNT7AO00755 349 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 SMPD1P17405 629 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 TRAPPC10P48553 1259 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 TTC38Q5R3I4 469 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ANO1Q5XXA6 986 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MBOAT7Q96N66 472 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 RNF208Q9H0X6 261 aa15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MAFGO15525 162 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ADCY6O43306 1168 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 SLC37A4O43826 429 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 F13A1P00488 732 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 TGFB3P10600 412 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 PTGS1P23219 599 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DDIT3P35638 169 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 SP2Q02086 613 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 NBR1Q14596 966 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ZNF174Q15697 407 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 Q4G0T1 1027 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DUSP28Q4G0W2 176 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 COPS5Q92905 334 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 LENG9Q96B70 501 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 UIMC1Q96RL1 719 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 SORBS3O60504 671 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ATP9AO75110 1047 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 BRD1O95696 1058 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 RARBP10826 455 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MCM7P33993 719 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 CENPFP49454 3210 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MSH4O15457 936 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 NEMFO60524 1076 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 MSCO60682 206 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 GGPS1O95749 300 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 KCNA2P16389 499 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 LHX8Q68G74 356 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 DEFB118Q96PH6 123 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3B-202ENST00000335760 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 MARCH6O60337 910 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 GH1P01241 217 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 NUCB2P80303 420 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 NEDD9Q14511 834 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 TLK2Q86UE8 772 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 GJA10Q969M2 543 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 PGK1P00558 417 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 ARHGAP1Q07960 439 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 CALCRLQ16602 461 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 SDF4Q9BRK5 362 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3B-202ENST00000335760 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms