RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 CIITAP33076 1130 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 GUCY1B3Q02153 619 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 MTMR1Q13613 665 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM63BQ5T3F8 832 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 KBTBD13C9JR72 458 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 DNM1LO00429 736 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 MEIS1O00470 390 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 CST5P28325 142 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 NEDD9Q14511 834 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 KLHDC9Q8NEP7 349 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 OR6J1Q8NGC5 347 aa30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 BRCA2P51587 3418 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 NR5A1Q13285 461 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 LAMC2Q13753 1193 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 GNASQ5JWF2 1037 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 COPS5Q92905 334 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 TNFRSF25Q93038 417 aa30.46■■■□□ 2.47
CRIP1-201ENST00000330233 ZEB2O60315 1214 aa30.45■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PDCP20941 246 aa30.45■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 SEMA3FQ13275 785 aa30.45■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 INF2Q27J81 1249 aa30.45■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 H3BQV1 296 aa30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CPT1AP50416 773 aa30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 SP2Q02086 613 aa30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 IFFO2Q5TF58 517 aa30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CYP2W1Q8TAV3 490 aa30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.44■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 FAM86B1E9PN63 330 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CAPN15O75808 1086 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 FAM86B2P0C5J1 330 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 NECAB2Q7Z6G3 386 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 NEK8Q86SG6 692 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2G4DQ86XP0 818 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 DOCK5Q9H7D0 1870 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 MLXIPQ9HAP2 919 aa30.43■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 MOXD2PA6NHM9 499 aa30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CTAGE5O15320 804 aa30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 GGPS1O95749 300 aa30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP1Q07960 439 aa30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA10Q16322 511 aa30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 MYSM1Q5VVJ2 828 aa30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 A6NJR5 290 aa30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 EDIL3O43854 480 aa30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 ARP10275 920 aa30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CYP3A7P24462 503 aa30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 MYADML2A6NDP7 307 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 KPNA6O60684 536 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PTGS1P23219 599 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 BEX3Q00994 111 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PRR16Q569H4 304 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 C11orf49Q9H6J7 331 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PHF24Q9UPV7 400 aa30.4■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 ATP9AO75110 1047 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA2P16389 499 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 RGS19P49795 217 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 BECN1Q14457 450 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 LETM2Q2VYF4 491 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 Q4G0T1 1027 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PPP4R3AQ6IN85 833 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 METTL7BQ6UX53 244 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 CYFIP1Q7L576 1253 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 PPTC7Q8NI37 304 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA33Q96N06 139 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 FOXD4L1Q9NU39 408 aa30.39■■■□□ 2.46
CRIP1-201ENST00000330233 ASGR1P07306 291 aa30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 ACLYP53396 1101 aa30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms