RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 CSRNP2Q9H175 543 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 GJD2Q9UKL4 321 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 WNT7AO00755 349 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 SLC26A4O43511 780 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 TDP2O95551 362 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PFKFB1P16118 471 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 LIG1P18858 919 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MAPK4P31152 587 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
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SYNE4-201ENST00000324444 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 DNERQ8NFT8 737 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D5Q92609 795 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 CLIC6Q96NY7 704 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MTMR9Q96QG7 549 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 HPSEQ9Y251 543 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 RPTORQ8N122 1335 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYNE4-201ENST00000324444 STAM2O75886 525 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 GJA8P48165 433 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PORCNQ9H237 461 aa20.34■□□□□ 0.85
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SYNE4-201ENST00000324444 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 NR1I2O75469 434 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 UBA7P41226 1012 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 NDUFA8P51970 172 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 POTEDQ86YR6 584 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SYNE4-201ENST00000324444 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 TNMDQ9H2S6 317 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.34■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF202O95125 648 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 ERCC3P19447 782 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CEP55Q53EZ4 464 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 IWS1Q96ST2 819 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 SDF4Q9BRK5 362 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.33■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.33■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 MAFGO15525 162 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 SLC37A4O43826 429 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 HMGCRP04035 888 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CCND2P30279 289 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TXKP42681 527 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PRR16Q569H4 304 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 GPR142Q7Z601 462 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PXMP2Q9NR77 195 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 EDIL3O43854 480 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CYP2B6P20813 491 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF445P59923 1031 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 KCTD2Q14681 263 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 NLRX1Q86UT6 975 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 IQUBQ8NA54 791 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CDHR1Q96JP9 859 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 DEFB118Q96PH6 123 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 COL20A1Q9P218 1284 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.31■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 POTEB2H3BUK9 544 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 MEIS1O00470 390 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 STRNO43815 780 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 SGPL1O95470 568 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 FCER1AP12319 257 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TECP42680 631 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM32Q13049 653 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PGM5Q15124 567 aa20.3■□□□□ 0.84
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