RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	TAP42	Q04372	366 aa		4.43	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	SOV1	Q04748	898 aa		4.43	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	RSA1	Q08932	381 aa		4.43	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	GRX6	Q12438	231 aa		4.43	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	ROX1	P25042	368 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	YCR100C	P25606	316 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	AVT5	P38176	459 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	YFL067W	P43537	175 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	CAF40	P53829	373 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	RTP1	Q12751	981 aa		4.42	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	PPH22	P23595	377 aa		4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	REC114	P32841	428 aa		4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	GCD10	P41814	478 aa		4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	POP6	P53218	158 aa		4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.41	□□□□□ -1.7
OMA1	YKR087C	HIP1	P06775	603 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SPS4	P09937	338 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	PMR1	P13586	950 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RED1	P14291	827 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	DSL1	P53847	754 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	ARK1	P53974	638 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	PNG1	Q02890	363 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	TLG2	Q08144	397 aa		4.4	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	GYP6	P32806	458 aa		4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	NAT2	P37293	288 aa		4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	PCP1	P53259	346 aa		4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	TAF11	Q04226	346 aa		4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RTN2	Q12443	393 aa		4.39	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	VTC2	P43585	828 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YPI1	P43587	155 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	GOR1	P53839	350 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	ODC1	Q03028	310 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	VTA1	Q06263	330 aa		4.38	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	CHS1	P08004	1131 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YOX1	P34161	385 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SAS3	P34218	831 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YCR041W	P37265	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RRT5	P43607	289 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	MUM3	Q08750	479 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RRD2	Q12461	358 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.37	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	HEM15	P16622	393 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	CLB3	P24870	427 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YIM1	P28625	365 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	NIP100	P33420	868 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	VHC1	P38329	1120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	NDT80	P38830	627 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YIL067C	P40514	678 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SPG5	P42933	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	TRS85	P46944	698 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	HSP31	Q04432	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.36	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	HCS1	P34243	683 aa		4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	JNM1	P36224	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YIP1	P53039	248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	SIL1	Q08199	421 aa		4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.35	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	ERG3	P32353	365 aa		4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YBL059W	P34224	193 aa		4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	YGL242C	P53066	181 aa		4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	RRN11	Q04712	507 aa		4.34	□□□□□ -1.71
OMA1	YKR087C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.33	□□□□□ -1.72	not detected
OMA1	YKR087C	SDS24	P38314	527 aa		4.33	□□□□□ -1.72
OMA1	YKR087C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
OMA1	YKR087C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
OMA1	YKR087C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
OMA1	YKR087C	IBD2	P53892	351 aa		4.33	□□□□□ -1.72

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.8 ms