RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	SFB3	P38810	929 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	COS5	P47187	383 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	CSM3	Q04659	317 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DXO1	Q06349	442 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	CDA2	Q06703	312 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	NCR1	Q12200	1170 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	GPR1	Q12361	961 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPN6	Q12377	434 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	PTC5	Q12511	572 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	COX2	P00410	251 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	COS2	P0CX12	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	COS3	P0CX13	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RAD14	P28519	371 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	IXR1	P33417	597 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YOX1	P34161	385 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	CLG1	P35190	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	ELF1	P36053	145 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DTR1	P38125	572 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TDP1	P38319	544 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	EAF5	P39995	279 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	NMD5	P46970	1048 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	VTA1	Q06263	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	WSC3	Q12215	556 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	FYV7	Q12247	151 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	REP1	P03871	373 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	IFM1	P25038	676 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	VMA3	P25515	160 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	ADY2	P25613	283 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	GIP1	P38229	639 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YBR287W	P38355	427 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	CIN4	P39110	191 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RRT14	P40470	206 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	POG1	P40473	351 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	SCY1	P53009	804 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YMD8	Q03697	442 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TRI1	Q05024	226 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	SYT1	Q06836	1226 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	SVS1	Q12254	260 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RTR2	Q12378	196 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPO26	P20435	155 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TUL1	P36096	758 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	MRPL36	P36531	177 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	AIM46	P38885	310 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	HPM1	P40481	377 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	PAC10	P48363	199 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YGL159W	P53110	370 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	SPC98	P53540	846 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	GLO2	Q05584	274 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	HIS5	P07172	385 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	QCR2	P07257	368 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	CKI1	P20485	582 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YPT7	P32939	208 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	MNN2	P38069	597 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	TAT1	P38085	619 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YBP1	P38315	674 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YKE4	P40544	346 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	PMT6	P42934	759 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	COS4	P43542	379 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	FMP33	P46998	180 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	GLO1	P50107	326 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	GPI1	P53306	609 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	ORC3	P54790	616 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YAT1	P80235	687 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	NKP2	Q06162	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	CNA1	P23287	553 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NUP133	YKR082W	YKL107W	P34251	309 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.4 ms