RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	CAF40	P53829	373 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	TAP42	Q04372	366 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	PPH22	P23595	377 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	YCR100C	P25606	316 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	RAD14	P28519	371 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	RRT5	P43607	289 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	GOR1	P53839	350 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	RRD2	Q12461	358 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSM27	YGR215W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	REV1	P12689	985 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YCR041W	P37265	110 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	NAT2	P37293	288 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	NDT80	P38830	627 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	ESL1	P40456	1118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	PCP1	P53259	346 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	JJJ1	P53863	590 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	MRPL19	P53875	158 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RHO2	P06781	192 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	CKA1	P15790	372 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	HEM15	P16622	393 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SEC66	P33754	206 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SWH1	P35845	1188 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SMF1	P38925	575 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	TRS85	P46944	698 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SOV1	Q04748	898 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YPL199C	Q08954	240 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	ROX1	P25042	368 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	NAM9	P27929	486 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SWE1	P32944	819 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	IRC6	P43615	237 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	PNG1	Q02890	363 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	PBA1	Q05778	276 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	GRX6	Q12438	231 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YIM1	P28625	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RPN12	P32496	274 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	NIP100	P33420	868 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YBL059W	P34224	193 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	ODC1	Q03028	310 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	COG4	Q06096	861 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SIL1	Q08199	421 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SPS4	P09937	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	CPR4	P25334	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	REC114	P32841	428 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	VTC2	P43585	828 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YIP1	P53039	248 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	DSL1	P53847	754 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SMA2	Q04658	369 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	INH1	P01097	85 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RED1	P14291	827 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	SAS3	P34218	831 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	NCA3	P46955	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YGL242C	P53066	181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	ESA1	Q08649	445 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	MUM3	Q08750	479 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RTN2	Q12443	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
RSM27	YGR215W	VHC1	P38329	1120 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	MRP51	Q02950	344 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	TAF11	Q04226	346 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	HSP31	Q04432	237 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RSM27	YGR215W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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