RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	SLY1	P22213	666 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PTC6	P25646	442 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CIN8	P27895	1000 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PRR1	P28708	518 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NDI1	P32340	513 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PET127	P32606	800 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YBR032W	P38223	100 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RRT2	P38332	387 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	LEU5	P38702	357 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PZF1	P39933	429 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NPP2	P39997	493 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	VAB2	P40003	282 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YAT2	P40017	923 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MAM33	P40513	266 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ORC5	P50874	479 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGR012W	P53206	393 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	VOA1	P53262	265 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PFA5	Q03289	374 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ECI1	Q05871	280 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SKM1	Q12469	655 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	EXO70	P19658	623 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YSP3	P25036	478 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	POF1	P25576	258 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SEC65	P29478	273 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TFB1	P32776	642 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PTM1	P32857	523 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SHP1	P34223	423 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FTH1	P38310	465 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SCC4	P40090	624 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YJR030C	P47101	745 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YBP2	P53169	641 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YNR062C	P53748	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	OSH6	Q02201	448 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TOF2	Q02208	771 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ARL3	Q02804	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PEX25	Q02969	394 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YLR407W	Q06070	228 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PHO92	Q06390	306 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	REH1	Q06709	432 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	IMA2	Q08295	589 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	TRM11	Q12463	433 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NCB2	Q92317	146 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CBF1	P17106	351 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CTR86	P25355	563 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	HCM1	P25364	564 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SSH4	P32343	579 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PAH1	P32567	862 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PHO11	P35842	467 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SKG1	P36169	355 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MAL32	P38158	584 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ERV15	P38312	142 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PHO12	P38693	467 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	GID8	P40208	455 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	NDE1	P40215	560 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SAD1	P43589	448 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PMT5	P52867	743 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	LCL3	P53153	274 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ERV14	P53173	138 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	YGR021W	P53212	290 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MAL12	P53341	584 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	OCA2	P53949	197 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	ACL4	Q03771	387 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PLM2	Q04383	521 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	APC4	Q04601	652 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	CDC123	Q05791	360 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	DCR2	Q05924	578 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	MPD2	Q99316	277 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DOA4	YDR069C	PEP5	P12868	1029 aa		3.09	□□□□□ -1.92
DOA4	YDR069C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.5 ms