RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SCFD2Q8WU76 684 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CERS4Q9HA82 394 aa28.03■■■□□ 2.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 KCNQ1P51787 676 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE4DQ08499 809 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A7Q96T83 725 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-216ENST00000628306 ANKS1AQ92625 1134 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SELPP16109 830 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.89■■■□□ 2.06
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