RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 SCLYQ96I15 445 aa15.43■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 PBX4Q9BYU1 374 aa15.43■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 LY9Q9HBG7 655 aa15.43■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MYH6P13533 1939 aa15.43■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 GRIN2CQ14957 1233 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 TIFAQ96CG3 184 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MAP3K14Q99558 947 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MTA3Q9BTC8 594 aa15.42■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 SLC27A2O14975 620 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 POLR2MP0CAP2 368 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 TRAF1Q13077 416 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 PGM5Q15124 567 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 SESTD1Q86VW0 696 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 IL31RAQ8NI17 732 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 BACH2Q9BYV9 841 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 ZNF576Q9H609 170 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 DLL1O00548 723 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 PRC1O43663 620 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 DDAH1O94760 285 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 LAMC2Q13753 1193 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 NECTIN1Q15223 517 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 PPTC7Q8NI37 304 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MYL10Q9BUA6 226 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-210ENST00000591412 PITPNM1O00562 1244 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PFKMP08237 780 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 FOSL2P15408 326 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 SMARCA1P28370 1054 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 SP2Q02086 613 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 DGKDQ16760 1214 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 CASC1Q6TDU7 716 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 HAS3O00219 553 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 IQCF3P0C7M6 154 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 MCM5P33992 734 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 RFC2P35250 354 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 RAB30Q15771 203 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PTGISQ16647 500 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 TMEM87BQ96K49 555 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 F2P00734 622 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 TGFB3P10600 412 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 CCND2P30279 289 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 KIF5BP33176 963 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 LIFRP42702 1097 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PSEN2P49810 448 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 CHMP4BP1P59074 171 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 BFSP2Q13515 415 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 TMTC2Q8N394 836 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 RETREG2Q8NC44 543 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 MSRAQ9UJ68 235 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 A0A0C4DFX4 3053 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 EYSQ5T1H1 3165 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PPFIA4O75335 1185 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 GGPS1O95749 300 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-210ENST00000591412 ZNF286BP0CG31 522 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms