RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 SESTD1Q86VW0 696 aa21.24■□□□□ 0.99
CTIF-206ENST00000588345 SENP2Q9HC62 589 aa21.24■□□□□ 0.99
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CTIF-206ENST00000588345 CYTH3O43739 400 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-206ENST00000588345 ANTXR2P58335 489 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-206ENST00000588345 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CTIF-206ENST00000588345 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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CTIF-206ENST00000588345 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.18■□□□□ 0.98
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CTIF-206ENST00000588345 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
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CTIF-206ENST00000588345 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-206ENST00000588345 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-206ENST00000588345 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-206ENST00000588345 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTIF-206ENST00000588345 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTIF-206ENST00000588345 SLC9A7Q96T83 725 aa21.15■□□□□ 0.98
CTIF-206ENST00000588345 PRC1O43663 620 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 GGPS1O95749 300 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 KIF5BP33176 963 aa21.14■□□□□ 0.97
CTIF-206ENST00000588345 ADGRE1Q14246 886 aa21.14■□□□□ 0.97
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