RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 CHMP4BP1P59074 171 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-232ENST00000568443 ARHGAP1Q07960 439 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-232ENST00000568443 NECTIN1Q15223 517 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-232ENST00000568443 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-232ENST00000568443 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-232ENST00000568443 MYL10Q9BUA6 226 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-232ENST00000568443 FGBP02675 491 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 CYP2C9P11712 490 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 MMP3P08254 477 aa26■■□□□ 1.75
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CLN3-232ENST00000568443 PGM5Q15124 567 aa26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 RASIP1Q5U651 963 aa26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 VSIG10LQ86VR7 867 aa26■■□□□ 1.75
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CLN3-232ENST00000568443 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 LZTS2Q9BRK4 669 aa26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SPZ1Q9BXG8 430 aa26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 WNT8AQ9H1J5 351 aa26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SMARCA1P28370 1054 aa25.99■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 GNAQP50148 359 aa25.99■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 LAMC2Q13753 1193 aa25.99■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 DGKDQ16760 1214 aa25.99■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 RNF20Q5VTR2 975 aa25.99■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.99■■□□□ 1.75
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CLN3-232ENST00000568443 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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CLN3-232ENST00000568443 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.98■■□□□ 1.75
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CLN3-232ENST00000568443 CCND2P30279 289 aa25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 LIFRP42702 1097 aa25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 HERVK_113Q902F9 699 aa25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SCLYQ96I15 445 aa25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 NOD1Q9Y239 953 aa25.98■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 RGS20O76081 388 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 CALM1P0DP23 149 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 CALM2P0DP24 149 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 CALM3P0DP25 149 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.96■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 IL31RAQ8NI17 732 aa25.96■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.96■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.96■■□□□ 1.75
CLN3-232ENST00000568443 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.95■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 RETREG2Q8NC44 543 aa25.95■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 PPTC7Q8NI37 304 aa25.95■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 PTGISQ16647 500 aa25.94■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.94■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 TIFAQ96CG3 184 aa25.94■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 BFSP2Q13515 415 aa25.93■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 MYLIPQ8WY64 445 aa25.93■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 SPATA33Q96N06 139 aa25.93■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 NEK1Q96PY6 1258 aa25.93■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.93■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 PBX4Q9BYU1 374 aa25.93■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 PBX2P40425 430 aa25.92■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.92■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 FANCBQ8NB91 859 aa25.92■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 ZNF576Q9H609 170 aa25.92■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.92■■□□□ 1.74
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CLN3-232ENST00000568443 STAM2O75886 525 aa25.91■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 RFC2P35250 354 aa25.91■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 PSEN2P49810 448 aa25.91■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 SP2Q02086 613 aa25.91■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CLN3-232ENST00000568443 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.91■■□□□ 1.74
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