RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 CHMP4BP1P59074 171 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 ARHGAP1Q07960 439 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 NECTIN1Q15223 517 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 MYL10Q9BUA6 226 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN3-215ENST00000565236 FGBP02675 491 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-215ENST00000565236 CYP2C9P11712 490 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-215ENST00000565236 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-215ENST00000565236 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.01■■□□□ 1.75
CLN3-215ENST00000565236 MMP3P08254 477 aa26■■□□□ 1.75
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CLN3-215ENST00000565236 RASIP1Q5U651 963 aa26■■□□□ 1.75
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CLN3-215ENST00000565236 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa26■■□□□ 1.75
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CLN3-215ENST00000565236 HERVK_113Q902F9 699 aa25.98■■□□□ 1.75
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CLN3-215ENST00000565236 CALM3P0DP25 149 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN3-215ENST00000565236 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CLN3-215ENST00000565236 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.96■■□□□ 1.75
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CLN3-215ENST00000565236 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.96■■□□□ 1.75
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CLN3-215ENST00000565236 NEK1Q96PY6 1258 aa25.93■■□□□ 1.74
CLN3-215ENST00000565236 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.93■■□□□ 1.74
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CLN3-215ENST00000565236 PBX2P40425 430 aa25.92■■□□□ 1.74
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CLN3-215ENST00000565236 RFC2P35250 354 aa25.91■■□□□ 1.74
CLN3-215ENST00000565236 PSEN2P49810 448 aa25.91■■□□□ 1.74
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CLN3-215ENST00000565236 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CLN3-215ENST00000565236 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.91■■□□□ 1.74
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