RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NEDD9Q14511 834 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX17Q15036 470 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD1Q15327 319 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RTN1Q16799 776 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CHST3Q7LGC8 479 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MICU3Q86XE3 530 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FERMT2Q96AC1 680 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR8Q96EF0 704 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 THEGQ9P2T0 379 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NOD1Q9Y239 953 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMA4Q16363 1823 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PIK3CDO00329 1044 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GNAT1P11488 350 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SMPD1P17405 629 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 EDNRBP24530 442 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GNA11P29992 359 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPA4P34932 840 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 GHRHRQ02643 423 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FPGSQ05932 587 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 BFSP2Q13515 415 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGA7Q13683 1181 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM60Q495X7 471 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXL16Q8N461 479 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RETREG2Q8NC44 543 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PPTC7Q8NI37 304 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PIGSQ96S52 555 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 IL25Q9H293 177 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PXMP2Q9NR77 195 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 REV3LO60673 3130 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PARP14Q460N5 1801 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0355O15063 1070 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PPFIA4O75335 1185 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TIMP1P01033 207 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PFKMP08237 780 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MYL3P08590 195 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTN1P12814 892 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY7P51828 1080 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NAPAP54920 295 aa6.43□□□□□ -1.38
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 C7orf31Q8N865 590 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 USP26Q9BXU7 913 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf50Q9HD87 102 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP54Q96N23 3096 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NJR5 290 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 FIBPO43427 364 aa6.42□□□□□ -1.38
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