RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518877.1

PCM1-208, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 3

Gene PCM1, Length 316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-208	ENST00000518877	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF76	P36508	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	STAT5A	P42229	794 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	GRB10	Q13322	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	THBD	P07204	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PLS3	P13797	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	FANCC	Q00597	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	C22orf46	C9J442	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	NKX3-2	P78367	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	SCRN1	Q12765	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-208	ENST00000518877	MUSK	O15146	869 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	GPR42	O15529	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KCNH1	O95259	989 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF28	P17035	718 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	SELENOP	P49908	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PPP2CB	P62714	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PPP2CA	P67775	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ADAM9	Q13443	819 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	DPF3	Q92784	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	MMP19	Q99542	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CYP7B1	O75881	506 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	FPR2	P25090	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	IL13	P35225	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	SLC6A11	P48066	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KLF10	Q13118	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	B4GALT4	O60513	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	INF2	Q27J81	1249 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	COPS5	Q92905	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877		A0A1W2PQH9	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	EPHB4	P54760	987 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	CEP68	Q76N32	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	PTPN18	Q99952	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	MYO1B	O43795	1136 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF623	O75123	536 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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