RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 LSAMPQ13449 338 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP2R1Q6VVX0 501 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR23CQ6ZRP0 262 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 CDIP1Q9H305 208 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 VTA1Q9NP79 307 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA3GQ9NS98 782 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf72A4D263 438 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ULK1O75385 1050 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D8O95759 1140 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL6P41182 706 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PANK1Q8TE04 598 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 GNALP38405 381 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK-21P61565 698 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TEKQ02763 1124 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNJ15Q99712 375 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OXSMQ9NWU1 459 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK13-1Q9NX77 482 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF3P18847 181 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2A2P52657 109 aa10.25□□□□□ -0.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 CRY1Q16526 586 aa10.25□□□□□ -0.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 C14orf80Q86SX3 495 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 NLRP10Q86W26 655 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CREG2Q8IUH2 290 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM52Q8NDY8 209 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CLDND1Q9NY35 253 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 NPHS1O60500 1241 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PEX14O75381 377 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ABLIM3O94929 683 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 EGR3Q06889 387 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 FAPQ12884 760 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN21Q16825 1174 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 INAVAQ3KP66 663 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 EFHBQ8N7U6 833 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 DPF3Q92784 378 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC5A5Q92911 643 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ATG3Q9NT62 314 aa10.24□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ESR1P03372 595 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE6AP16499 860 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SESN3P58005 492 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC8Q8TAM2 541 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SHKBP1Q8TBC3 707 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 JAM3Q9BX67 310 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 BTG4Q9NY30 223 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.23□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 MYBL2P10244 700 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 DDB1Q16531 1140 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM102BQ5T8I3 360 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM169Q96HH4 297 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 BOCQ9BWV1 1114 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.22□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 H7BY64 318 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TGM5O43548 720 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT37O76014 449 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 MT-CO1P00395 513 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIK1P39086 918 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 GATA4P43694 442 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
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