RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDPK1O15530 556 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRGAP3O43295 1099 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPHS1O60500 1241 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPP00450 1065 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DBHP09172 617 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATF2P15336 505 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TACR1P25103 407 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASGRF1Q13972 1273 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GULP1Q9UBP9 304 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLI4P10075 376 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BICRALQ6AI39 1079 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIPIQ6XZB0 460 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATC1Q76KD6 591 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LZTR1Q8N653 840 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLX3O60479 287 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYBBP04839 570 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ6P48051 423 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP4K2Q12851 820 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR1I3Q14994 352 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQCEQ6IPM2 695 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FERMT3Q86UX7 667 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA25Q9BR10 227 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PQJ5 194 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3D21A4FU49 640 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGFR1P11362 822 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASA3Q14644 834 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIO2Q92813 273 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OSBP2Q969R2 916 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IER2Q9BTL4 223 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADCY3O60266 1144 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCP1P13796 627 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF1AP19438 455 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTBRP36941 435 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXO4P98177 505 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNAB2Q13303 367 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOGA3Q5TF21 947 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 K7ESM1 405 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRODHO43272 600 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FUCA1P04066 466 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PFKLP17858 780 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTERF2Q49AM1 385 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MKL1Q969V6 931 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNTG2Q9NY99 539 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F8W031 263 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR5P85299 388 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTRK3Q16288 839 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBXN11Q5T124 520 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRP10Q86W26 655 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q8N1Y9 231 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NETO2Q8NC67 525 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms