RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 LAMB2P55268 1798 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 LRRC53A6NM62 1247 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RIMBP2O15034 1052 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 EDIL3O43854 480 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SLURP2P0DP57 97 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MYBL2P10244 700 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 AKR1B1P15121 316 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PLCG2P16885 1265 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 GTF2IP78347 998 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SEMA3FQ13275 785 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ECM1Q16610 540 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 UNC13DQ70J99 1090 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.37□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SNED1Q8TER0 1413 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RGL2O15211 777 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TACC1O75410 805 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ACTN2P35609 894 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PPP1R2P41236 205 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 KIF11P52732 1056 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 COG1Q8WTW3 980 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RAB34Q9BZG1 259 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 POLLQ9UGP5 575 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 A0A1W2PQJ5 194 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TRAF5O00463 557 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 BUB1O43683 1085 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RNF40O75150 1001 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ATP2B4P23634 1241 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MAGEA1P43355 309 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 DNA2P51530 1060 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RASSF7Q02833 373 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MAN2A1Q16706 1144 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MAP9Q49MG5 647 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 FIGNQ5HY92 759 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TRIM58Q8NG06 486 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 FAM71BQ8TC56 605 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RAD54LQ92698 747 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 EHD2Q9NZN4 543 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 STK17AQ9UEE5 414 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.36□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ESYT2A0FGR8 921 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 NCK2O43639 380 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 IL1R1P14778 569 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MCM3P25205 808 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SLC7A5Q01650 507 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 APBA1Q02410 837 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ARID5AQ03989 594 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 KCTD1Q719H9 257 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 CREG2Q8IUH2 290 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SLF2Q8IX21 1173 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 MXD3Q9BW11 206 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.35□□□□□ -1.23
RAD51B-210ENST00000487270 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms