RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 MTMR8Q96EF0 704 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP1Q07960 439 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 LAMC2Q13753 1193 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PIGSQ96S52 555 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PITPNM1O00562 1244 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 POLR2MP0CAP2 368 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PTGISQ16647 500 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 CASC1Q6TDU7 716 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.331e-22■■□□□ 11.6
ACTB-212ENST00000484841 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 C7orf31Q8N865 590 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 MAP4K1Q92918 833 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 SCN5AQ14524 2016 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 IQCF3P0C7M6 154 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 CCND2P30279 289 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 KIF5BP33176 963 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 GHRHRQ02643 423 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 OPLAHO14841 1288 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PGM5Q15124 567 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 SESTD1Q86VW0 696 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 CAGE1Q8TC20 777 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 ALG1Q9BT22 464 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 RABGGTBP53611 331 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 TROAPQ12815 778 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PPTC7Q8NI37 304 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SENP2Q9HC62 589 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 IGFBP4P22692 258 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PSEN2P49810 448 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MFSD10Q14728 455 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PPM1EQ8WY54 764 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CUL5Q93034 780 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SLC9A7Q96T83 725 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CCDC69A6NI79 296 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 DDAH1O94760 285 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 TGFB3P10600 412 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MCM5P33992 734 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 GNPTABQ3T906 1256 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 TMTC2Q8N394 836 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SPATA33Q96N06 139 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 KIF28PB7ZC32 967 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CYTH3O43739 400 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SORBS3O60504 671 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PPFIA4O75335 1185 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 GGPS1O95749 300 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 GNAQP50148 359 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 KAT2BQ92831 832 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K14Q99558 947 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 MTA3Q9BTC8 594 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 PRC1O43663 620 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 ZNF286BP0CG31 522 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 SELPP16109 830 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-212ENST00000484841 KCNJ6P48051 423 aa23.28■■□□□ 1.32
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