RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 EPHX3Q9H6B9 360 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 SENP2Q9HC62 589 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 CD320Q9NPF0 282 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 ZSWIM5Q9P217 1185 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 HDAC6Q9UBN7 1215 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 HAS3O00219 553 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 TLL1O43897 1013 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 SORBS3O60504 671 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 CXCL10P02778 98 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 PFKMP08237 780 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 RFC2P35250 354 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 WDR5P61964 334 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 SP2Q02086 613 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 PTGISQ16647 500 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 CYB5R4Q7L1T6 521 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 MTMR8Q96EF0 704 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 SLC9A7Q96T83 725 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-206ENST00000474188 ZNF286BP0CG31 522 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CKBP12277 381 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 RBL2Q08999 1139 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 SEC23AQ15436 765 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 RMDN3Q96TC7 470 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ABCB11O95342 1321 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 KPNA6O60684 536 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GH1P01241 217 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 NR3C2P08235 984 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PSEN2P49810 448 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 HSD17B4P51659 736 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GHRHRQ02643 423 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GDPD5Q8WTR4 605 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ESR2Q92731 530 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ALG1Q9BT22 464 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 SUGCTQ9HAC7 445 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PXMP2Q9NR77 195 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 LAMA4Q16363 1823 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ZNF213O14771 459 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CYTH3O43739 400 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 F2P00734 622 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PCP11498 1178 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 SELPP16109 830 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PDE4AP27815 886 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 NUCB1Q02818 461 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 BFSP2Q13515 415 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 HSDL1Q3SXM5 330 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 TICAM2Q86XR7 235 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 RETREG2Q8NC44 543 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 AFAP1L1Q8TED9 768 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PDCD2LQ9BRP1 358 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 C16orf70Q9BSU1 422 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 LINC01553A4QN01 128 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 BAIAP3O94812 1187 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GJB5O95377 273 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ACTN1P12814 892 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 SEMA3FQ13275 785 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MFSD10Q14728 455 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 STXBP2Q15833 593 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ASPRV1Q53RT3 343 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 FAM117BQ6P1L5 589 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 FBXO11Q86XK2 927 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CAGE1Q8TC20 777 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 IWS1Q96ST2 819 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 LGR5O75473 907 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CFBP00751 764 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms