RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417339.2

CENPVL3-201, Transcript of centromere protein V like 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL3, Length 864 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3-201ENST00000417339 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 EYSQ5T1H1 3165 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 FOSL2P15408 326 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 KAT2BQ92831 832 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 MYL10Q9BUA6 226 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 MAF1Q9H063 256 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 A0A0C4DFX4 3053 aa24.91■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 ERICH2A1L162 156 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 KPNA6O60684 536 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 RGS20O76081 388 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 GHRHRQ02643 423 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.9■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 RABGGTBP53611 331 aa24.89■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.89■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CENPVL3-201ENST00000417339 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 LY9Q9HBG7 655 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.88■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 MYOGP15173 224 aa24.87■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PGM5Q15124 567 aa24.87■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 USP38Q8NB14 1042 aa24.87■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.87■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PTPRSQ13332 1948 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.86■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 ZBBXA8MT70 800 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF286BP0CG31 522 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 SP2Q02086 613 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 ALG1Q9BT22 464 aa24.85■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC27A2O14975 620 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PRC1O43663 620 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 IQCF3P0C7M6 154 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 POLR2MP0CAP2 368 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 RXRAP19793 462 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PTGISQ16647 500 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 MSRAQ9UJ68 235 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.84■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 PSEN2P49810 448 aa24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 NOD1Q9Y239 953 aa24.83■■□□□ 1.57
CENPVL3-201ENST00000417339 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 LAMC2Q13753 1193 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 ADGRE1Q14246 886 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 HIC1Q14526 733 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 DGKDQ16760 1214 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 RETREG2Q8NC44 543 aa24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 GGPS1O95749 300 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 CCND2P30279 289 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 GPNMBQ14956 572 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 RAB30Q15771 203 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 SESTD1Q86VW0 696 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 PPTC7Q8NI37 304 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.81■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 HAS3O00219 553 aa24.8■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 PITPNM1O00562 1244 aa24.8■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 MFSD10Q14728 455 aa24.8■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 NECTIN1Q15223 517 aa24.8■■□□□ 1.56
CENPVL3-201ENST00000417339 CASC1Q6TDU7 716 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms