RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416606.1

TFAP2C-202, Transcript of transcription factor AP-2 gamma, humanhuman

TSL 3

Gene TFAP2C, Length 482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2C-202ENST00000416606 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 COPS5Q92905 334 aa22.13■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.13■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.13■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.13■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CALM1P0DP23 149 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CALM2P0DP24 149 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CALM3P0DP25 149 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 ACRP10323 421 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CCL23P55773 120 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 LY6KQ17RY6 165 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 HOMER1Q86YM7 354 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PPTC7Q8NI37 304 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CAGE1Q8TC20 777 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 AFG1LQ8WV93 481 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PIGSQ96S52 555 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 ZNF576Q9H609 170 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 MSRAQ9UJ68 235 aa22.12■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 COL6A3P12111 3177 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CYTH3O43739 400 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PPFIA4O75335 1185 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 ACTN1P12814 892 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 LIFRP42702 1097 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 ANTXR2P58335 489 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PGM5Q15124 567 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 NOD1Q9Y239 953 aa22.11■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CCND2P30279 289 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 GNPTABQ3T906 1256 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 RNF20Q5VTR2 975 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PBX4Q9BYU1 374 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 LY9Q9HBG7 655 aa22.1■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CYP2C9P11712 490 aa22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 FOSL2P15408 326 aa22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 NECTIN1Q15223 517 aa22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CCDC69A6NI79 296 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 DLL1O00548 723 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PRC1O43663 620 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PTGISQ16647 500 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 CHST3Q7LGC8 479 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 SENP2Q9HC62 589 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.08■■□□□ 1.13
TFAP2C-202ENST00000416606 PIK3CDO00329 1044 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 F2P00734 622 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 IQCF3P0C7M6 154 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 RBL2Q08999 1139 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 C7orf31Q8N865 590 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 MYLIPQ8WY64 445 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 KAT2BQ92831 832 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 CUL5Q93034 780 aa22.07■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SLC27A2O14975 620 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 RGS20O76081 388 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 ICAM3P32942 547 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SCLYQ96I15 445 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.06■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 HAS3O00219 553 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 BAIAP3O94812 1187 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 NEDD9Q14511 834 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 GRIN2CQ14957 1233 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.05■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 PSEN2P49810 448 aa22.04■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.04■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.04■■□□□ 1.12
TFAP2C-202ENST00000416606 SPATA33Q96N06 139 aa22.04■■□□□ 1.12
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