RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 BUB1O43683 1085 aa27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 PPFIBP2Q8ND30 876 aa27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 DCAF4Q8WV16 495 aa27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 KDM6BO15054 1643 aa27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 PODNQ7Z5L7 613 aa27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 NOL3O60936 208 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 IFNAR1P17181 557 aa27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 COPB1P53618 953 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 GH2P01242 217 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 LMNB1P20700 586 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 PDXDC2PQ6P474 469 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 RNF207Q6ZRF8 634 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.978e-9■■■■■ 32.9
SPIRE1-202ENST00000409402 UBE2SQ16763 222 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 MUM1L1Q5H9M0 696 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 BBS5Q8N3I7 341 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 THAP12O43422 761 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 BFSP1Q12934 665 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 TRIM11Q96F44 468 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 AFPP02771 609 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 MEIS1O00470 390 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 ZBTB7AO95365 584 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 CEP85LQ5SZL2 805 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 CCDC62Q6P9F0 684 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 OGFRQ9NZT2 677 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 ATP8B3O60423 1300 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 MYL1P05976 194 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 PRPSAP1Q14558 356 aa27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1-202ENST00000409402 P2RX5Q93086 422 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 TET3O43151 1660 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 LIFRP42702 1097 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 CCDC68Q9H2F9 335 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 NEDD9Q14511 834 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 SASH1O94885 1247 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 MAP7Q14244 749 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 DGKHQ86XP1 1220 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 FBXO40Q9UH90 709 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 GOLGA8CPA6NN73 597 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 MYO1EQ12965 1108 aa27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 MCAMP43121 646 aa27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 HAUS4Q9H6D7 363 aa27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 PTCH1Q13635 1447 aa27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 SYNE4Q8N205 404 aa27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 KRT71Q3SY84 523 aa27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 C4orf50Q6ZRC1 276 aa27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 NDUFAB1O14561 156 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 SEPT2Q15019 361 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 ZBTB33Q86T24 672 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF233A6NK53 670 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 MYO1FO00160 1098 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 MYCP01106 439 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF131P52739 623 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 PARVGQ9HBI0 331 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 PLA2R1Q13018 1463 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 XPAP23025 273 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 CACNB3P54284 484 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 LRRC41Q15345 812 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 FAM149B1Q96BN6 582 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 CD209Q9NNX6 404 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 H7C0C1 242 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 ATP5OP48047 213 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 SURF1Q15526 300 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 DESI2Q9BSY9 194 aa27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 KAZNQ674X7 775 aa27.29■■□□□ 1.96
SPIRE1-202ENST00000409402 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms