RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MSH4O15457 936 aa22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TKFCQ3LXA3 575 aa22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PXMP2Q9NR77 195 aa22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MARCH6O60337 910 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ITGB5P18084 799 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ERCC3P19447 782 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.232e-7■□□□□ 10.1
ODC1-202ENST00000405333 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PGM5Q15124 567 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CNNM3Q8NE01 707 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 LRRC15Q8TF66 581 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.75■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PNOCQ13519 176 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 E2F4Q16254 413 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CEP55Q53EZ4 464 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CHST13Q8NET6 341 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TIGD1Q96MW7 591 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ARP10275 920 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 RGMBQ6NW40 437 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.74■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ASTN1O14525 1302 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 UBA7P41226 1012 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CNTN2Q02246 1040 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PNMA3Q9UL41 463 aa22.73■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 FSD2A1L4K1 749 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PRR29P0C7W0 189 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ERVK-9P63128 1117 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ERVK-24P63145 666 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CABP7Q86V35 215 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 STAMQ92783 540 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 AK8Q96MA6 479 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MEIS1O00470 390 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CASP1P29466 404 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PORCNQ9H237 461 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 DISC1Q9NRI5 854 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.72■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 CTAGE5O15320 804 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 FSTL1Q12841 308 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 RBSNQ9H1K0 784 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TSPY26PQ9H489 355 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.71■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SLFN14P0C7P3 912 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TXLNAP40222 546 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 AFMP43652 599 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 TYRO3Q06418 890 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PDIA5Q14554 519 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 MTRQ99707 1265 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.7■■□□□ 1.23
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 TBX3O15119 743 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PLCG1P19174 1290 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ECM1Q16610 540 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 EFCC1Q9HA90 598 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 VAV3Q9UKW4 847 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.7■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 BIN1O00499 593 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PGK2P07205 417 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 NR3C2P08235 984 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SLC10A3P09131 477 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 WDR78Q5VTH9 848 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 IQUBQ8NA54 791 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 RNF214Q8ND24 703 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PAGE5Q96GU1 130 aa22.69■■□□□ 1.22
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