RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317378.5

TRAPPC5-201, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 790 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-201ENST00000317378 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 MAP4K1Q92918 833 aa23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 SENP2Q9HC62 589 aa23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 RGS20O76081 388 aa23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 IQCF3P0C7M6 154 aa23.69■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 LAMC2Q13753 1193 aa23.68■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.68■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.68■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.67■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.67■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.67■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 PPTC7Q8NI37 304 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 CAGE1Q8TC20 777 aa23.66■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 ACTN1P12814 892 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC5-201ENST00000317378 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 HOMER1Q86YM7 354 aa23.65■■□□□ 1.38
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TRAPPC5-201ENST00000317378 MTA3Q9BTC8 594 aa23.64■■□□□ 1.37
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TRAPPC5-201ENST00000317378 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.63■■□□□ 1.37
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TRAPPC5-201ENST00000317378 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 SMARCA1P28370 1054 aa23.61■■□□□ 1.37
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TRAPPC5-201ENST00000317378 C7orf31Q8N865 590 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 LY9Q9HBG7 655 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 TRANK1O15050 2925 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 BAIAP3O94812 1187 aa23.6■■□□□ 1.37
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