RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prl2c2P04095 224 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdrg1P59048 133 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsg101Q61187 391 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rexo1Q7TT28 1213 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k11Q80XI6 850 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PaoxQ8C0L6 504 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kbtbd4Q8R179 534 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc5Q99LG4 440 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col1a1P11087 1453 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npr3P70180 536 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr832Q7TRG9 312 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Haus2Q9CQS9 234 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nap1l5Q9JJF0 156 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc4bP0C192 709 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nf2P46662 596 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Meis3P97368 378 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rcor2Q8C796 523 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ciapin1Q8WTY4 309 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plagl2Q925T4 496 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc27a3O88561 667 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcp11Q01755 566 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Armcx3Q8BHS6 379 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr247E9PVJ7 320 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr819K7N727 320 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EporP14753 507 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IbspQ61711 324 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CbarpQ66L44 698 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Papd7Q6PB75 542 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc41Q8K1C9 807 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc5a5Q99PN0 618 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psma7Q9Z2U0 248 aa23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MtrA6H5Y3 1253 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mpp3O88910 568 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lig1P37913 916 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem232Q5K6N0 675 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r209Q5NC97 312 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mettl25Q6NXH8 597 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcorl1A2AQH4 1781 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mroh8E9PYI4 1049 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apol10bG3X9K7 334 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha4O88689 947 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptger2Q62053 362 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd24Q80VM7 985 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NapaQ9DB05 295 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klra17Q9JMA4 273 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx12O70493 165 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Meis2P97367 477 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncf1Q09014 390 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsun7Q14AW5 724 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ErfeQ6PGN1 340 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a5Q810P8 197 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Haus4Q8BFT2 363 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx19bQ8BZY3 494 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oxnad1Q8VE38 311 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc96Q9CR92 584 aa23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmc2P46471 433 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbln1Q08879 705 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlr13Q6R5N8 991 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC048507Q80ZS7 89 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Depdc1aQ8CIG0 804 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sar1bQ9CQC9 198 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Orc4O88708 433 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efcab8Q8C9R9 203 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bhmt2Q91WS4 363 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnaaf5B9EJR8 853 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CnpP16330 420 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcif1P59114 706 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Top1Q04750 767 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ItgadQ3V0T4 1168 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Islr2Q5RKR3 745 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zswim4Q8C7B8 1101 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd248Q91V98 765 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gmcl1Q920G9 524 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif3cO35066 796 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NeblQ0II04 452 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EregQ61521 162 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fez2Q6TYB5 348 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hook2Q7TMK6 716 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.1 ms