Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Atp1a2Q6PIE5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Atp1a2Q6PIE5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atp1a2Q6PIE5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Atp1a2Q6PIE5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Atp1a2Q6PIE5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Atp1a2Q6PIE5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Atp1a2Q6PIE5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atp1a2Q6PIE5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp1a2Q6PIE5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp1a2Q6PIE5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atp1a2Q6PIE5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atp1a2Q6PIE5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atp1a2Q6PIE5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atp1a2Q6PIE5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Atp1a2Q6PIE5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atp1a2Q6PIE5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp1a2Q6PIE5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atp1a2Q6PIE5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp1a2Q6PIE5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atp1a2Q6PIE5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atp1a2Q6PIE5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp1a2Q6PIE5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1a2Q6PIE5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Atp1a2Q6PIE5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atp1a2Q6PIE5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Atp1a2Q6PIE5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atp1a2Q6PIE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atp1a2Q6PIE5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atp1a2Q6PIE5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atp1a2Q6PIE5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atp1a2Q6PIE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp1a2Q6PIE5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Atp1a2Q6PIE5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp1a2Q6PIE5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp1a2Q6PIE5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atp1a2Q6PIE5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp1a2Q6PIE5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp1a2Q6PIE5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp1a2Q6PIE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp1a2Q6PIE5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Atp1a2Q6PIE5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atp1a2Q6PIE5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Atp1a2Q6PIE5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atp1a2Q6PIE5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1a2Q6PIE5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1a2Q6PIE5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Atp1a2Q6PIE5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1a2Q6PIE5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1a2Q6PIE5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atp1a2Q6PIE5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1a2Q6PIE5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1a2Q6PIE5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp1a2Q6PIE5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp1a2Q6PIE5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1a2Q6PIE5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atp1a2Q6PIE5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1a2Q6PIE5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp1a2Q6PIE5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1a2Q6PIE5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atp1a2Q6PIE5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atp1a2Q6PIE5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atp1a2Q6PIE5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atp1a2Q6PIE5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atp1a2Q6PIE5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atp1a2Q6PIE5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Atp1a2Q6PIE5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Atp1a2Q6PIE5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1a2Q6PIE5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atp1a2Q6PIE5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atp1a2Q6PIE5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp1a2Q6PIE5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp1a2Q6PIE5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1a2Q6PIE5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp1a2Q6PIE5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1a2Q6PIE5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1a2Q6PIE5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1a2Q6PIE5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1a2Q6PIE5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1a2Q6PIE5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1a2Q6PIE5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1a2Q6PIE5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1a2Q6PIE5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1a2Q6PIE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp1a2Q6PIE5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1a2Q6PIE5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1a2Q6PIE5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1a2Q6PIE5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1a2Q6PIE5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1a2Q6PIE5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1a2Q6PIE5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp1a2Q6PIE5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp1a2Q6PIE5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp1a2Q6PIE5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp1a2Q6PIE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp1a2Q6PIE5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms