Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Atp1a2Q6PIE5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,56■■■■□ 3,44
Atp1a2Q6PIE5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Atp1a2Q6PIE5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Atp1a2Q6PIE5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Atp1a2Q6PIE5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,7■■■■□ 3,15
Atp1a2Q6PIE5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Atp1a2Q6PIE5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Atp1a2Q6PIE5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Atp1a2Q6PIE5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Atp1a2Q6PIE5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Atp1a2Q6PIE5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Atp1a2Q6PIE5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Atp1a2Q6PIE5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Atp1a2Q6PIE5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Atp1a2Q6PIE5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Atp1a2Q6PIE5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Atp1a2Q6PIE5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Atp1a2Q6PIE5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Atp1a2Q6PIE5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Atp1a2Q6PIE5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Atp1a2Q6PIE5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Atp1a2Q6PIE5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
Atp1a2Q6PIE5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Atp1a2Q6PIE5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Atp1a2Q6PIE5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Atp1a2Q6PIE5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Atp1a2Q6PIE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Atp1a2Q6PIE5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Atp1a2Q6PIE5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Atp1a2Q6PIE5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Atp1a2Q6PIE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Atp1a2Q6PIE5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Atp1a2Q6PIE5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Atp1a2Q6PIE5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Atp1a2Q6PIE5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Atp1a2Q6PIE5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Atp1a2Q6PIE5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Atp1a2Q6PIE5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Atp1a2Q6PIE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Atp1a2Q6PIE5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Atp1a2Q6PIE5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Atp1a2Q6PIE5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Atp1a2Q6PIE5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Atp1a2Q6PIE5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Atp1a2Q6PIE5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Atp1a2Q6PIE5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Atp1a2Q6PIE5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Atp1a2Q6PIE5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Atp1a2Q6PIE5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Atp1a2Q6PIE5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Atp1a2Q6PIE5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Atp1a2Q6PIE5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Atp1a2Q6PIE5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Atp1a2Q6PIE5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Atp1a2Q6PIE5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Atp1a2Q6PIE5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Atp1a2Q6PIE5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Atp1a2Q6PIE5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Atp1a2Q6PIE5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Atp1a2Q6PIE5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Atp1a2Q6PIE5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp1a2Q6PIE5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Atp1a2Q6PIE5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atp1a2Q6PIE5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Atp1a2Q6PIE5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,4
Atp1a2Q6PIE5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Atp1a2Q6PIE5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp1a2Q6PIE5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Atp1a2Q6PIE5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Atp1a2Q6PIE5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Atp1a2Q6PIE5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Atp1a2Q6PIE5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Atp1a2Q6PIE5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Atp1a2Q6PIE5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Atp1a2Q6PIE5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Atp1a2Q6PIE5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Atp1a2Q6PIE5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Atp1a2Q6PIE5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Atp1a2Q6PIE5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp1a2Q6PIE5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp1a2Q6PIE5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Atp1a2Q6PIE5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Atp1a2Q6PIE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp1a2Q6PIE5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Atp1a2Q6PIE5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Atp1a2Q6PIE5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Atp1a2Q6PIE5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Atp1a2Q6PIE5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Atp1a2Q6PIE5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Atp1a2Q6PIE5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Atp1a2Q6PIE5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Atp1a2Q6PIE5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Atp1a2Q6PIE5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Atp1a2Q6PIE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Atp1a2Q6PIE5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms