RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifnar1P33896 590 aa22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm7aQ3UWM4 940 aa22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PRAG1Q571I4 1179 aa22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem232Q5K6N0 675 aa22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srrm3Q80WV7 648 aa22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr1i2O54915 431 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pth1rP41593 591 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mybl2P48972 704 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam196bQ6GQV1 535 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exoc8Q6PGF7 716 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atxn7Q8R4I1 867 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gucy1a2F8VQK3 730 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt18P05784 423 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NntQ61941 1086 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Txndc16Q7TN22 820 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bpifb6Q8BU51 449 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem60Q8K174 133 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psma7Q9Z2U0 248 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm42641I6L9G2 585 aa22.93■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aco1P28271 889 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AtripQ8BMG1 785 aa22.93■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4307E9PZY4 289 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4312K9J7E2 289 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcna1P16388 495 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ncf1Q09014 390 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrimpolQ6P1E7 537 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hs2st1Q8R3H7 356 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hdac9Q99N13 588 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RpainQ9CWY9 219 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl10Q9D5V2 608 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt78E9Q0F0 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lilrb3P97484 841 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gcnt1Q09324 428 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klra4Q60651 263 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dusp9Q7TNL7 452 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P3h4Q8K2B0 443 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TbcbQ9D1E6 244 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5114W4VSN8 858 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa22.92■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Armc3A2AU72 881 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm28042B7ZCM9 1014 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr5a1P33242 462 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm2163Q6PCY5 473 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kctd3Q8BFX3 815 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spice1Q8C804 860 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp15Q8R5H1 981 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sept3Q9Z1S5 350 aa22.91■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ugt1a8D3Z748 530 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ugt1a10E9PXN7 530 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CnpP16330 420 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gna11P21278 359 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clul1Q3ZRW6 464 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgef2Q60875 985 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exoc1Q8R3S6 894 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MymkQ9D1N4 221 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klf15Q9EPW2 415 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stat2Q9WVL2 923 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Surf6P70279 355 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sap30bpQ02614 308 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LgsnQ8CIX8 563 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plagl2Q925T4 496 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mis18aQ9CZJ6 204 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Inpp4aQ9EPW0 939 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh2b2Q9JID9 621 aa22.9■■□□□ 1.26
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Magea10A2AMW4 325 aa22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp781Q0P5U5 243 aa22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gxylt1Q3UHH8 404 aa22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh3gl2Q62420 352 aa22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnph1Q80VJ3 173 aa22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif2bQ8C0N1 668 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.5 ms