Protein–RNA interactions for Protein: Q60651

Klra4, Killer cell lectin-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra4Q60651 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Klra4Q60651 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Klra4Q60651 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Klra4Q60651 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Klra4Q60651 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Klra4Q60651 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Klra4Q60651 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Klra4Q60651 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Klra4Q60651 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Klra4Q60651 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Klra4Q60651 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Klra4Q60651 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Klra4Q60651 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Klra4Q60651 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Klra4Q60651 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Klra4Q60651 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Klra4Q60651 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Klra4Q60651 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Klra4Q60651 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Klra4Q60651 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Klra4Q60651 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Klra4Q60651 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Klra4Q60651 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Klra4Q60651 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Klra4Q60651 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klra4Q60651 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Klra4Q60651 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Klra4Q60651 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Klra4Q60651 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Klra4Q60651 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Klra4Q60651 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Klra4Q60651 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Klra4Q60651 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klra4Q60651 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klra4Q60651 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klra4Q60651 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Klra4Q60651 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klra4Q60651 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klra4Q60651 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klra4Q60651 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klra4Q60651 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klra4Q60651 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Klra4Q60651 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klra4Q60651 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klra4Q60651 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Klra4Q60651 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Klra4Q60651 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klra4Q60651 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klra4Q60651 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klra4Q60651 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klra4Q60651 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klra4Q60651 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klra4Q60651 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Klra4Q60651 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klra4Q60651 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Klra4Q60651 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Klra4Q60651 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klra4Q60651 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Klra4Q60651 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klra4Q60651 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klra4Q60651 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Klra4Q60651 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klra4Q60651 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klra4Q60651 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klra4Q60651 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klra4Q60651 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klra4Q60651 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klra4Q60651 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klra4Q60651 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klra4Q60651 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Klra4Q60651 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klra4Q60651 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klra4Q60651 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Klra4Q60651 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Klra4Q60651 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Klra4Q60651 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Klra4Q60651 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Klra4Q60651 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Klra4Q60651 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Klra4Q60651 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Klra4Q60651 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Klra4Q60651 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Klra4Q60651 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klra4Q60651 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klra4Q60651 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klra4Q60651 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klra4Q60651 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Klra4Q60651 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klra4Q60651 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klra4Q60651 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Klra4Q60651 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klra4Q60651 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klra4Q60651 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klra4Q60651 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms