RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C YDL242WQ07746 117 aa3.28□□□□□ -1.88
HRD1YOL013C GSH2Q08220 491 aa3.28□□□□□ -1.88
HRD1YOL013C YOR012WQ12351 137 aa3.28□□□□□ -1.88
HRD1YOL013C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C AAC1P04710 309 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C UNG1P12887 359 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ART10P18634 518 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C IMG1P25626 169 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YBR139WP38109 508 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MSG5P38590 489 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ELO1P39540 310 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C XBP1P40489 647 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C OPT1P40897 799 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YFR018CP43599 363 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YGL242CP53066 181 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C OCA2P53949 197 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SMA1Q02651 245 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SMA2Q04658 369 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ORM2Q06144 216 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C AEP3Q12089 606 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C BAG7Q12128 409 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RAD61Q99359 647 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C KOG1P38873 1557 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SAG1P20840 650 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ADH7P25377 361 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C GSH1P32477 678 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SIP1P32578 815 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C TMT1P32643 299 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C PIM1P36775 1133 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MSR1P38714 643 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ECM10P39987 644 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C AIM22P47051 409 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C COS5P47187 383 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RAD17P48581 401 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MPS2P53159 387 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C PNC1P53184 216 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MSC1Q03104 513 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YMR130WQ04223 302 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C STE23Q06010 1027 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C DCS1Q06151 350 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YFH1Q07540 174 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C COS7Q07788 383 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YAP7Q08182 245 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C INP53Q12271 1107 aa3.27□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ATG2P53855 1592 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C TDH1P00360 332 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ARG81P05085 880 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C PET111P08468 800 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C GDA1P32621 518 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C RPC34P32910 317 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C NUP133P36161 1157 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C CCL1P37366 393 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MMS4P38257 691 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SPT8P38915 602 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MNN9P39107 395 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C UBX6P47049 396 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C CRT10Q08226 957 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C VAM3Q12241 283 aa3.26□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C THO2P53552 1597 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SSK2P53599 1579 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C COX3P00420 269 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C HXK2P04807 486 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ILV5P06168 395 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SPS22P25380 463 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C GEX1P25596 615 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C LAC1P28496 418 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C MRPL9P31334 269 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C HIR2P32480 875 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C TPO5P36029 618 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C APD1P38281 316 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C PCA1P38360 1216 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C DED81P38707 554 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C SSO2P39926 295 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C AIM20P40451 204 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C VHS2P40463 436 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C NMD5P46970 1048 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C TOM22P49334 152 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C YGL185CP53100 379 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C TEN1Q07921 160 aa3.25□□□□□ -1.89
HRD1YOL013C LCB4Q12246 624 aa3.25□□□□□ -1.89
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