RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DSS4P32601 143 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TFA2P36145 328 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SSY5P47002 699 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W IBD2P53892 351 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ATG21Q02887 496 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YMR155WQ03795 547 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SWA2Q06677 668 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NUS1Q12063 375 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPC82P32349 654 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MAL33P38157 468 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YER121WP40076 114 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ECM9Q02202 377 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YMR210WQ03649 449 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YDR286CQ05530 114 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W VHS3Q08438 674 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W THR4P16120 514 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2.8□□□□□ -1.96 RIP-Chip
SIN3YOL004W ATF1P40353 525 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ROG3P43602 733 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LIA1P47120 325 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SOL1P50278 321 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YNL144CP53907 740 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YPL191CQ08930 360 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ATG9Q12142 997 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YLR108CQ12259 485 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W OAR1P35731 278 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CEM1P39525 442 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W IRC5P43610 853 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GLG2P47011 380 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HOP2P53187 214 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GCR2Q01722 534 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HNT3Q08702 217 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HOS1Q12214 470 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GLO4Q12320 285 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MHF1Q3E835 90 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YCK2P23292 546 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W AFG1P32317 509 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W BZZ1P38822 633 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W WSS1P38838 269 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YAT2P40017 923 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MPH1P40562 993 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TEL2P53038 688 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W EMC1P25574 760 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LRG1P35688 1017 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W OAF3P36023 863 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YBP1P38315 674 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YJR012CP47087 207 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARI1P53111 347 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARE2P53629 642 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SNO2P53823 222 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YPL071CQ02864 156 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W AIM32Q04689 311 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W COQ9Q05779 260 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W BMT6Q12291 365 aa2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARG3P05150 338 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MRT4P33201 236 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YLF2P38746 405 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CGR1P53188 120 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PEX31P53203 462 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MHR1Q06630 226 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RSB1Q08417 382 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ACM1Q08981 209 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPC31P17890 251 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NTG1P31378 399 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PMT2P31382 759 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W APD1P38281 316 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SER33P40510 469 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HST3P53687 447 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SRL2Q12020 392 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARP6Q12509 438 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PMD1P32634 1753 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W APN1P22936 367 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W POL4P25615 582 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MSP1P28737 362 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W APT2P36973 181 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W OTU2P38747 307 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
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