RNA–Protein interactions for RNA: YMR178W

YMR178W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YMR178W, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR178W	YMR178W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	EXO70	P19658	623 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SMF1	P38925	575 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	IRC15	Q02733	499 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	BNA5	Q05979	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	GRX6	Q12438	231 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SET6	Q12529	373 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	MDM31	P38880	579 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	RPH1	P39956	796 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	YGL108C	P53139	140 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	VPS74	Q06385	345 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	RTN2	Q12443	393 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	YCR022C	P25620	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	AFG1	P32317	509 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SPC110	P32380	944 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SEC66	P33754	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SHO1	P40073	367 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SYG1	P40528	902 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	ELP2	P42935	788 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	SRB7	P47822	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	RKM5	Q12367	367 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR178W	YMR178W	PHO2	P07269	559 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RAD14	P28519	371 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	ATP11	P32453	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	CBP4	P37267	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RPR2	P40571	144 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	SLG1	P54867	378 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	PPT2	Q12036	173 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	AYT1	Q12226	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	CYB2	P00175	591 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	ERG3	P32353	365 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YJL213W	P40896	331 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YGR149W	P48236	432 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	TAP42	Q04372	366 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	PPH22	P23595	377 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	BUB3	P26449	341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	SAS3	P34218	831 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RSM22	P36056	628 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	ALG8	P40351	577 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	GWT1	P47026	490 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	URB2	P47108	1174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RHO2	P06781	192 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	CLB3	P24870	427 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	FRE2	P36033	711 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	PMU1	P36069	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	HAT2	P39984	401 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
YMR178W	YMR178W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	SCM3	Q12334	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	SFI1	Q12369	946 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	ATP10	P18496	279 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	AGA1	P32323	725 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	THI2	P38141	450 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	KRE9	P39005	276 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	FAU1	P40099	211 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	YDL186W	P48568	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	RTT103	Q05543	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	HEM2	P05373	342 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	SPS4	P09937	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YMR178W	YMR178W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74

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