RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	FRE2	P36033	711 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	YGR021W	P53212	290 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	HAL1	Q01766	294 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CSI1	YMR025W	FAB1	P34756	2278 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	MRP13	P12686	339 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	AFG3	P39925	761 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	IBD2	P53892	351 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	YML037C	Q03703	340 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	SPE4	Q12455	300 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	SGS1	P35187	1447 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	BUB3	P26449	341 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	PAH1	P32567	862 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	RSM22	P36056	628 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	MRP21	P38175	177 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	CBK1	P53894	756 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	TOF2	Q02208	771 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	KAR3	P17119	729 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	PAN6	P40459	309 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	POP6	P53218	158 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	YSA1	Q01976	231 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	ELO2	P25358	347 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	SIM1	P40472	476 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	AIM22	P47051	409 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	LCL3	P53153	274 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	BSC5	P53755	489 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	SKM1	Q12469	655 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	DAL2	P25335	343 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	POL4	P25615	582 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	HCS1	P34243	683 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	MIX23	P38162	196 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	IPI3	P53877	555 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	YPL199C	Q08954	240 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CSI1	YMR025W	PRM5	P40476	318 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	DNA2	P38859	1522 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	STB6	P36085	766 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	NCA3	P46955	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	PEX25	Q02969	394 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RSN1	Q03516	953 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	YCR100C	P25606	316 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	ATP11	P32453	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	MID2	P36027	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RRN3	P36070	627 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	CCT6	P39079	546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	YCK1	P23291	538 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	MSG5	P38590	489 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	MSR1	P38714	643 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	IES5	P40060	125 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	ALG5	P40350	334 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	ODC1	Q03028	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	COR1	P07256	457 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
CSI1	YMR025W	SEF1	P34228	1148 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	HER2	Q03557	464 aa		3.11	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	YBL029W	P38201	376 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	FDH1	Q08911	376 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	SWR1	Q05471	1514 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	SPS22	P25380	463 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	SYG1	P40528	902 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CSI1	YMR025W	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	CHS3	P29465	1165 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	MNS1	P32906	549 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	MBB1	P39534	108 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	POP1	P41812	875 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	TRS85	P46944	698 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CSI1	YMR025W	KOG1	P38873	1557 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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