RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SRD1	P09007	221 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	APA2	P22108	325 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CIN8	P27895	1000 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CHS3	P29465	1165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HXT1	P32465	570 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DUG2	P38149	878 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YBR071W	P38243	211 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YDR089W	P38966	869 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FLC2	P39719	783 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	UBP5	P39944	805 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YER010C	P40011	234 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DSE1	P40077	573 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GTO1	P48239	356 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TAF4	P50105	388 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CUL3	P53202	744 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YGR045C	P53229	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RCF2	P53721	224 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ASI2	P53895	289 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RUB1	Q03919	77 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SND1	Q04007	877 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PHO92	Q06390	306 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FRE5	Q08908	694 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AFT2	Q08957	416 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GIS3	Q12418	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	COR1	P07256	457 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MAS1	P10507	462 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RAD18	P10862	487 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	WHI2	P12611	486 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DPH2	P32461	534 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPD3	P32561	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SUR1	P33300	382 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SPC29	P33419	253 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	LEU5	P38702	357 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	EXO1	P39875	702 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	IMA5	P40884	581 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CIN1	P40987	1014 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MLC1	P53141	149 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YGR026W	P53217	278 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RSM27	P53305	110 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NCE103	P53615	221 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YNR068C	P53754	272 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SCS7	Q03529	384 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YMD8	Q03697	442 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SEG1	Q04279	960 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TRE2	Q08693	809 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AVL9	Q12500	764 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MPD2	Q99316	277 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GAL10	P04397	699 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ENA1	P13587	1091 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SNT1	P25357	1226 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CTS1	P29029	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MEI5	P32489	222 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GIC1	P38785	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PTC7	P38797	343 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GSM1	P42950	618 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CIA1	Q05583	330 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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