RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	TOM1	Q03280	3268 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	STE3	P06783	470 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ARG1	P22768	420 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YME2	P32843	850 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PMT1	P33775	817 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	GEX2	P36173	615 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	APN2	P38207	520 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YHR045W	P38775	560 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SMF2	P38778	549 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PZF1	P39933	429 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	UBP5	P39944	805 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SCC4	P40090	624 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	HXT14	P42833	540 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	OTU1	P43558	301 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MND1	P53102	219 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	TWF1	P53250	332 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MUB1	Q03162	620 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	VPS38	Q05919	439 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ATG26	Q06321	1198 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ECM30	Q06673	1274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	STP4	Q07351	490 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	TMA16	Q08687	178 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	VIK1	Q12045	647 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	HKR1	P41809	1802 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	CDC23	P16522	626 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ATP11	P32453	318 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	HXT1	P32465	570 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	HCS1	P34243	683 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	RSM22	P36056	628 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SAK1	P38990	1142 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	NUP60	P39705	539 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	VFA1	P40080	203 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SMC3	P47037	1230 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YHC3	P47040	408 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PET130	P47065	347 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YGL114W	P53134	725 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YGR012W	P53206	393 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YGR067C	P53243	804 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	INN1	P53901	409 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MSC2	Q03455	724 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	BNA7	Q04066	261 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PPN1	Q04119	674 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	FUS2	Q05670	677 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	CDA2	Q06703	312 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ICL2	Q12031	575 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SUL2	Q12325	893 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SPE4	Q12455	300 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	GAL80	P04387	435 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ARG81	P05085	880 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	UGA1	P17649	471 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ADY2	P25613	283 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	BEM1	P29366	551 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MAL32	P38158	584 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SFB3	P38810	929 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MLH1	P38920	769 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	END3	P39013	349 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	FMC1	P40491	155 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
YMD8	YML038C	YJL107C	P42947	387 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ECM27	P47144	725 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	RMR1	P53060	241 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	TIM21	P53220	239 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	MAL12	P53341	584 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	SPO19	Q03029	223 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ASM4	Q05166	528 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	RTT103	Q05543	409 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	NNT1	Q05874	261 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	ADY4	Q05955	493 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	GPN3	Q06543	272 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	GET4	Q12125	312 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	NTO1	Q12311	748 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	YOS9	Q99220	542 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YMD8	YML038C	GAL10	P04397	699 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YIH1	P25637	258 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ALG5	P40350	334 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YIR042C	P40586	236 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MAF1	P41910	395 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	BNA6	P43619	295 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YJL132W	P47014	750 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	TAH11	P47112	604 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YGR149W	P48236	432 aa		5.15	□□□□□ -1.59

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