RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	IRC15	Q02733	499 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	VPS74	Q06385	345 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	REV3	P14284	1504 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	ATR1	P13090	542 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	SHO1	P40073	367 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	ESL1	P40456	1118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	IRC6	P43615	237 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	COS10	P52924	374 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	TWF1	P53250	332 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MDG1	P53885	366 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	SLG1	P54867	378 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	PDS5	Q04264	1277 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	ATG29	Q12092	213 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YML133C	Q03099	1374 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	CPR3	P25719	182 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	ATP11	P32453	318 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	RPN12	P32496	274 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	SEC66	P33754	206 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	CMC1	P36064	111 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	PMU1	P36069	295 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	VID24	P38263	362 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	ALG8	P40351	577 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MET18	P40469	1032 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YJL132W	P47014	750 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	URB2	P47108	1174 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	COG4	Q06096	861 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	AYT1	Q12226	474 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YCR022C	P25620	114 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	GPI10	P30777	616 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	AGA1	P32323	725 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	TUL1	P36096	758 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YBP1	P38315	674 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YHR218W	P38899	603 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	NDE1	P40215	560 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	HXT14	P42833	540 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	GWT1	P47026	490 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	YGL108C	P53139	140 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	JJJ1	P53863	590 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	RIM20	Q12033	661 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	RTP1	Q12751	981 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	IRC20	Q06554	1556 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YLR224W	YLR224W	HEM2	P05373	342 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CBP4	P37267	147 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	HAT2	P39984	401 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	FAU1	P40099	211 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SYG1	P40528	902 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	POP1	P41812	875 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MRPL19	P53875	158 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RKM5	Q12367	367 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	DNF1	P32660	1571 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CKA1	P15790	372 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	ROX1	P25042	368 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	BUB3	P26449	341 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	PMT1	P33775	817 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	IDP2	P41939	412 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	TAP42	Q04372	366 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SOV1	Q04748	898 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	GRX6	Q12438	231 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RHO2	P06781	192 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RAD14	P28519	371 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	GYP6	P32806	458 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RSM22	P36056	628 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SMF1	P38925	575 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
YLR224W	YLR224W	CTF3	Q12748	733 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	INH1	P01097	85 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MET17	P06106	444 aa		2.74	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms