RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL047W	YLL047W	FOB1	O13329	566 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	COR1	P07256	457 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	MRP7	P12687	371 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	TUL1	P36096	758 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	SRO77	P38163	1010 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	MBB1	P39534	108 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	HAT2	P39984	401 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	TWF1	P53250	332 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	BOR1	P53838	576 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	HEM2	P05373	342 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	GWT1	P47026	490 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	PMR1	P13586	950 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	ATS1	P31386	333 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	AGA1	P32323	725 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	GYP6	P32806	458 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	CST26	P38226	397 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
YLL047W	YLL047W	YEL057C	P39983	233 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	FAU1	P40099	211 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	SPO22	P40511	975 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
YLL047W	YLL047W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	MFB1	Q04922	465 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	ATG29	Q12092	213 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	YCR022C	P25620	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	ATP11	P32453	318 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	CMC1	P36064	111 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	VID24	P38263	362 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	MET18	P40469	1032 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	IRC6	P43615	237 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	YGL242C	P53066	181 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	JJJ1	P53863	590 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	SOV1	Q04748	898 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	CTF3	Q12748	733 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	AVT5	P38176	459 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	YPI1	P43587	155 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	HNT3	Q08702	217 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL047W	YLL047W	RHO2	P06781	192 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	BUB3	P26449	341 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	CBP4	P37267	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	TIM10	P87108	93 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	TAP42	Q04372	366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RSA1	Q08932	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RTP1	Q12751	981 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	ARG3	P05150	338 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	YGL108C	P53139	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	CAF40	P53829	373 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
YLL047W	YLL047W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	YBR139W	P38109	508 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	PCA1	P38360	1216 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	SYG1	P40528	902 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	DOT5	P40553	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	HXT14	P42833	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RIM20	Q12033	661 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RAD14	P28519	371 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	REC114	P32841	428 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	SWE1	P32944	819 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RSM22	P36056	628 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	ESL1	P40456	1118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	POP1	P41812	875 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	VTC2	P43585	828 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	ARK1	P53974	638 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RKM5	Q12367	367 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	GRX6	Q12438	231 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	HIP1	P06775	603 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	YOX1	P34161	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	GCD10	P41814	478 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	RRN11	Q04712	507 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
YLL047W	YLL047W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	NDI1	P32340	513 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	FRE2	P36033	711 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	SDS24	P38314	527 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YLL047W	YLL047W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.6 ms