RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	MRP13	P12686	339 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	APE1	P14904	514 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	NDC1	P32500	655 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YPT6	Q99260	215 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	MRS3	P10566	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	DOT5	P40553	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	RTT101	P47050	842 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	MSC1	Q03104	513 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	SCW10	Q04951	389 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	SET6	Q12529	373 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	BUD14	P27637	709 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YME1	P32795	747 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YHR210C	P38893	341 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	VPS52	P39904	641 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	EAF6	P47128	113 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YGR066C	P53242	292 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	TOF2	Q02208	771 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	VPS38	Q05919	439 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	THP1	Q08231	455 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	CTI6	Q08923	506 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	CBS1	P14066	229 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	SHP1	P34223	423 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	MSR1	P38714	643 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	RMD8	P43620	662 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YJR154W	P47181	346 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	IVY1	Q04934	453 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YKR070W	YKR070W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	CCT6	P39079	546 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RPH1	P39956	796 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.71	□□□□□ -1.82	not detected
YKR070W	YKR070W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	MRX6	P48564	524 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RPM2	Q02773	1202 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.71	□□□□□ -1.82	not detected
YKR070W	YKR070W	SPT7	P35177	1332 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	GAL80	P04387	435 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	EXO70	P19658	623 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	BNA4	P38169	460 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YBP1	P38315	674 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YJL213W	P40896	331 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SLD5	Q03406	294 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	COQ9	Q05779	260 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SYO1	Q07395	620 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RLM1	Q12224	676 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	AVL9	Q12500	764 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	GCN4	P03069	281 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	CPR3	P25719	182 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ATS1	P31386	333 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SPC110	P32380	944 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	FRE1	P32791	686 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	KRE9	P39005	276 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.69	□□□□□ -1.82	not detected
YKR070W	YKR070W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.69	□□□□□ -1.82	not detected
YKR070W	YKR070W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	IRC15	Q02733	499 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YCR007C	P25354	239 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	UTR4	P32626	227 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SHO1	P40073	367 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RPR2	P40571	144 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ELP2	P42935	788 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YDL186W	P48568	277 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	GPI1	P53306	609 aa		3.68	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.9 ms