RNA–Protein interactions for RNA: YJR069C

HAM1, Transcript of Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, yeast

Gene HAM1, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAM1	YJR069C	BCH1	Q05029	724 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	CIA1	Q05583	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	ULA1	Q12059	462 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	PSY3	Q12318	242 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	ARG3	P05150	338 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	SNF4	P12904	322 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	MDJ1	P35191	511 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	UBA4	P38820	440 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	IRR1	P40541	1150 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	GTO1	P48239	356 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	MRK1	P50873	501 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RMR1	P53060	241 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YNL095C	P53932	642 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	SDH1	Q00711	640 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	PPN1	Q04119	674 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RAD33	Q04231	177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	NKP1	Q12493	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	SEM1	O94742	89 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	AI3	P03877	415 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RSR1	P13856	272 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	MET8	P15807	274 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	KIN3	P22209	435 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	DMC1	P25453	334 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.35	□□□□□ -1.23	not detected
HAM1	YJR069C	PXA2	P34230	853 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RMD8	P43620	662 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	VEL1	P53058	206 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	FLC3	P53121	802 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	DSL1	P53847	754 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	MPS1	P54199	764 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	TMN2	Q04562	672 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RAD34	Q06665	692 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RSB1	Q08417	382 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YDR056C	Q12025	205 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	ARG81	P05085	880 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	STE3	P06783	470 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	CDC21	P06785	304 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	PCL5	P38794	229 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	MOB1	P40484	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YGL176C	P46945	554 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	EMC4	P53073	190 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	UGO1	Q03327	502 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	CCE1	Q03702	353 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YDR239C	Q03780	787 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	VHS1	Q03785	461 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	ATG17	Q06410	417 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	FLC1	Q08967	793 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	PST1	Q12355	444 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HAM1	YJR069C	DST1	P07273	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	SEC63	P14906	663 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	SIR1	P21691	654 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	CMK2	P22517	447 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	CLB3	P24870	427 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	VMA3	P25515	160 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	SOL2	P37262	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	BMT2	P38278	337 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	YHL012W	P38709	493 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	MPH1	P40562	993 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	GAB1	P41733	394 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	SPR6	Q01684	191 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	IRC15	Q02733	499 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	RSC3	Q06639	885 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	MLH3	Q12083	715 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	MHT1	Q12525	324 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	POL4	P25615	582 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	KAP122	P32767	1081 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	SDH3	P33421	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	YCR087C-A	P37263	153 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	IML3	P38265	245 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	ERV46	P39727	415 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HAM1	YJR069C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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